Grupo A:
Mais uma vez o Fortaleza/CE se classificou para as quartas da Terceirona, em anos anteriores o clube cearense sobrou na 1ª fase e acabou caindo no mata-mata. Ao lado do Leão do Pici, se classificaram para a 2ª fase: ABC/RN, Botafogo/PB e ASA/AL.
Um dos clubes mais tradicionais do Nordeste caiu para a Série D. No últimos 10 anos, o América de Natal chegou a disputar a Série A, por diversas vezes a Série B. Em 2016, a queda para 4ª Divisão frustou torcedores e dirigentes. O outro rebaixado do Grupo A foi o River/PI que tinha subido no último ano.
Classificação Final:
1º Fortaleza 30
2º ABC 30
3º Botafogo/PB 28
4º ASA 26
5º Remo 25
6º Cuiabá 22
7º Confiança 22
8º Salgueiro 21
9º América de Natal 20
10º River/PI 13
Grupo B:
Um dos clubes mais tradicionais do futebol brasileiro conseguiu se classificar com autoridade, o Guarani/SP terminou a 1ª fase com 38 pontos. O Boa Esporte/MG, que recentemente disputou a Série B também conseguiu a classificação, além de Botafogo/SP e Juventude/RS.
Após a polêmica e o rebaixamento envolvendo a Portuguesa/SP na Série A de 2013, o time paulista tem sofrido acumulando diversos rebaixamentos. Hoje a Lusa foi rebaixada para a Série D de 2017, depois de perder para o Tombense/GO. O outro rebaixado do Grupo B foi o Guaratinguetá/SP.
Classificação Final:
1º Guarani 38
2º Boa Esporte 35
3º Botafogo/SP 31
4º Juventude 30
5º Tombense 29
6º Ypiranga/RS 28
7º Mogi Mirim 22
8º Macaé 16
9º Portuguesa/SP 14
10º Guaratinguetá/SP 04
Quartas de Finais (Jogos de Ida):
Juventude __X__ Fortaleza
Botafogo/PB __X__ Boa Esporte
Botafogo/SP __X__ ABC
ASA __X__ Guarani
